Vie du laboratoire :
- Merci à tous les doctorants qui sont en train ou qui viennent de renouveler leur inscription à l’Université d’indiquer à Laurence Jagot (
Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser. ), par un court mail, que votre réinscription est effective quand tel est le cas, de sorte qu’elle puisse mettre à jour les informations RH de notre Unité. - Merci à tous ceux qui ont participé au Team Building de bien vouloir renseigner le questionnaire d’évaluation préparé par Fanny et Denis : https://forms.gle/TrWVaWdJTJnHC3bR9
- Christophe attire votre attention sur 2 fonctionnalités sous-exploitées actuellement, et documentées sur le site LITO :
- Procédure de backup : Backup available at the lito
- GitHub du laboratoire : gitlab du LITO
Portrait express de la semaine : Ombeline Lamer
- Ombeline est bio-informaticienne, fraîchement diplômée du Master Bioinformatique et Biostatistiques de l’Université Paris Saclay. Elle a réalisé son stage de Master de l’IRBA (Institut Biomédicale de Recherche des Armées), sur l’analyse multi-omique de la résistance aux antibiotiques chez B.pseudomallei. En attente d’un nouveau contrat à l’IRBA, Ombeline se familiarise avec l’imagerie médicale et l’analyse d’images dans LIFEx, et a pour mission, dans le cadre d’un CDD de 2 mois renouvelable, d’actualiser la documentation de LIFEx. Et qui sait, peut-être arriverons-nous à la convaincre que la radiomique vaut bien l’analyse des autres omiques ?
Pour contacter Ombeline :Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.
A lire :
- Un nouveau biomarqueur TEP d’agressivité tumorale ultra simple ? Jolie dérivation, jolis résultats, à confirmer bien sur : https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33536339/
- De la part de Fanny : une réflexion intéressante sur l’importance de l’analyse causale lors de l’usage de méthodes d’apprentissage en imagerie médicale : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7376027/
Qq appels à projet d’intérêt :
- ANR - Appel à projets génériques, avec des nouveautés cette année : https://anr.fr/fr/detail/call/appel-a-projets-generique-aapg-2022/ Date limite des pré-propositions le 28 octobre 2022
- ITMO Cancer : PCSI (Physique, Chimie et Sciences pour l'Ingénieur) : https://eva3-accueil.inserm.fr/sites/eva/appels-a-projets/pca/Pages/pcsi.aspx Date limite le 16 décembre 2021
- ITMO Cancer : MIC (Mathématiques et Informatique) : https://eva3-accueil.inserm.fr/sites/eva/appels-a-projets/pca/Pages/MIC.aspx Date limite le 6 janvier 2022
Agenda :
- Mardi 26 octobre 14h Marie-Judith présentera un travail intitulé « Decrypting the information captured by MRI Radiomic features in predicting the response to neoadjuvant chemotherapy in breast cancer » et soumis à IEEE ISBI
- Mercredi 10 novembre 14h : Présentation de Kibrom : Data-centric AI to easily measure prognostic biomarkers in DLBCL patients
- Mercredi 17 novembre 14h : Présentation de Fahad (Projet BIOMEDE-IA sur gliomes infiltrants du tronc cérébral)
- en attente de confirmation Mercredi 24 novembre 14h : Présentation de Louis (Projet lymphomes)
- Mercredi 1 décembre 14h Présentation de Christophe : Nouveautés LIFEx
- en attente de confirmation Mardi 7 décembre 14h
- Mercredi 15 décembre 14h Retour du congrès EANM 2021 : Fanny et Vesna
Le défi du mois de Novembre (proposé par Christophe) :
- Concours multi-sites de la meilleure photo des installations (pour illustrer le site Web): où que vous travailliez, envoyez à
Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser. une ou des photos illustrant : 1/le bâtiment vu de l’extérieur et/ou 2/l’intérieur du labo et/ou 3/ les équipements du laboratoires (imageurs, machines, bureaux, etc).
Il y aura 1 gagnant / site ;-) avec à la clef : un mug ou une gourde LITO.
La photo de la semaine :
détection totalement automatique de ganglions médiastinaux envahis (en vert) chez des patients atteints de cancer du poumon par une méthode d’apprentissage profond appliquée à des images TEP/TDM, sans intervention humaine aucune, avec des performances non significativement différentes de celles d’un médecin nucléaire. Travail de David Wallis fraichement publié dans l’EJNMMI : https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00259-021-05513-x
Une méthode d'apprentissage profond pour la détection automatisée des ganglions lymphatiques médiastinaux pathologiques dans les scanners FDG-TEP/TDM | Life Sciences Université Paris-Saclay | Scoop.it